MBA学院工作领导小组：由校长任组长、分管副校长为副组长，相关学院、职能处室负责人为成员，负责指导制定MBA的相关政策及基础管理规章制度，协调配置校内优质办学资源，监控培养各环节工作的实施情况，研究和处理MBA教育工作中的重大事项。
MBA教学指导委员会：由分管副校长任主任，成员由校内专家、校外知名学者、经济管理部门和行业协会负责人、大型企业高管组成，为我校的MBA教学提供指导、咨询。
MBA学院：为单独建制的教学管理机构，下设行政管理办公室、招生管理办公室、教学管理办公室、学员管理办公室、职业发展中心等部门，全面负责MBA的招生管理、课程设置、师资管理、论文答辩、学员管理、职业发展等工作。
浙江财经大学管理案例中心：隶属MBA学院。作为MBA学院的案例研究与开发部门，对内联系MBA课程教师与学员，推动教学质量提升，吸引优秀教师参与MBA教学；对外联系本土典型性企业，总结实践典范；参与中外商学院案例教学与研究网络，成为工商管理理论研究与教学联系商业实践的桥梁。主任由MBA学院院长兼任，设常务副主任一名，其它工作人员与MBA学院合署办公。
